芸術科学会論文誌 投稿用カバーシート

■ 論文種類
  ・原著論文 フルペーパー    

■ 論文分野
  2) 科学系分野

■ カテゴリ（1個以上選択）
  a-4) CG技術(可視化)

■ 該当特集（以下のうちから一つ選択）
  ・特集名「NICOGRAPH 2012発表論文特集」

■ 論文題名(和文、英文)
蛋白質ポケットのdruggability分析のための可視化ツール
Visualization for Druggbaility Analysis of Protein Pockets

■ 著者名(和文、英文)
金子彩香（非会員）
中村友香理（非会員）
伊藤貴之（正会員）
…
Ayaka Kaneko
Yukari Nakamura
Takayuki Itoh
…

■ 著者所属(和文、英文)
お茶の水女子大学大学院　人間文化創成科学研究科
Graduate School of Humanities and Sciences, Ochanomizu University

■ 著者e-mail
itot@is.ocha.ac.jp

■ 連絡担当者の氏名、住所、所属、電話、Fax、e-mail
氏名　伊藤貴之
住所　東京都文京区大塚2-1-1 お茶の水女子大学理学部情報科学科
所属　お茶の水女子大学 大学院人間文化創成科学研究科
電話  03-5978-5399
e-mail　itot@is.ocha.ac.jp

■ 論文概要(和文400字程度、英文100ワード程度)
薬は人体の重要な構成成分である蛋白質に作用する．薬との親和性の高さをdruggabilityといい，親和性の高い蛋白質の発見は製薬過程における重要な課題である．近年の研究では，薬成分の多くは蛋白質表面上の窪み（ポケット）に反応することが知られており，我々もdruggableなポケットに対する抽出・分析の研究を進めてきた．本論文では，蛋白質表面形状に対し，ポケットを抽出する手法，並びに，ポケットのdruggability分析のための2種類の可視化ツールを提案する．ポケット抽出手法では，三角メッシュで構成された蛋白質表面上に対し，メッシュ単純化により微小凹凸を平滑化し，その表面上から凹部をポケットとして抽出する．druggability分析のための1つ目の可視化ツールでは，形状の観点から各ポケットのdruggability推定値を算出し可視化する．2つ目の可視化ツールでは，各ポケットの特徴量を2軸に割り当てた散布図とポケット形状を1画面上に表示する．

Research of protein is pivotal to the drug discovery, since most of the drugs act upon proteins inside human body. Drugs act when they are close to the concave portions, so called “pockets”, of the protein surfaces. Therefore, detection and analysis of the pockets are also important for the drug discovery. This paper presents a fast method with pocket extraction and evaluation technique for the protein surfaces. When the protein surfaces are provided as triangular meshes, the method first applies mesh simplification to smoothing small geometric features. It then detects concave portions as pockets from the simplified triangular meshes. The method then evaluates the pockets from the following viewpoints: geometry and chemistry.

■ キーワード(和文5個程度、英文5個程度)
蛋白質，ポケット，druggability，抽出，分析
protein, pocket, druggability, extraction, analysis